一般都要求可分析根系的長度、直徑、面積、體積、根尖數(shù)、分叉數(shù)、根交叉數(shù)等。更專業(yè)一點的根系分析系統(tǒng)，還可分析植物根系的主側(cè)根拓撲形態(tài)關(guān)系、連接關(guān)系，以及根尖部位的色彩變化，以便進行根系形態(tài)和構(gòu)造研究。新的根系分析系統(tǒng)應(yīng)具備大批量圖像的全自動分析特性，用戶可對自動分析結(jié)果進行局部的交互編輯修正，以確保數(shù)據(jù)的科學(xué)性。

　　

　　對原位根系圖像，因根系與土壤的顏色可能非常接近，故國內(nèi)外均采用圖像中根系目標(biāo)的自動增強后，以交互引導(dǎo)的方式進行標(biāo)記分析的。

　　

　　另外，還有引入分形維數(shù)，以及直方圖投影來進行根系整體生物量分析的。根系分析的新技術(shù)還可分析根瘤菌體積在根系中的占比，以客觀確定根瘤菌體的貢獻量。

　　

　　根系分析系統(tǒng)包括有尺寸標(biāo)定、長度測量以及數(shù)據(jù)導(dǎo)出等輔助測量的功能。